home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Shareware Overload Trio 2 / Shareware Overload Trio Volume 2 (Chestnut CD-ROM).ISO / dir26 / med9410p.zip / M94A3277.TXT < prev    next >
Text File  |  1994-10-25  |  2KB  |  33 lines
  1.        Document 3277
  2.  DOCN  M94A3277
  3.  TI    Patterns of amino acid substitutions in the third variable envelope
  4.        region for HIV within a host.
  5.  DT    9412
  6.  AU    Gojobori T; Yamaguchi Y; National Institute of Genetics, Shizuoka,
  7.        Japan.
  8.  SO    Int Conf AIDS. 1994 Aug 7-12;10(1):112 (abstract no. PA0069). Unique
  9.        Identifier : AIDSLINE ICA10/94369298
  10.  AB    OBJECTIVE: The purpose of this study is to examine the patterns of amino
  11.        acid changes in the third variable envelope (V3) region of HIV by
  12.        phylogenetic methods. The substitution patterns obtained would be useful
  13.        to develop effective vaccines. METHODS: We constructed phylogenetic
  14.        trees by use of nucleotide sequences of HIV within a host. Then, we
  15.        estimated the number of each kind of amino acid substitutions for the V3
  16.        region. RESULTS: We found hypervariable sites in the V3 region. At these
  17.        hypervariable sites, certain types of amino acid substitutions were
  18.        dominantly favored by HIV. In particular, it is observed that most of
  19.        amino acid substitutions were caused by single nucleotide substitutions
  20.        at each codon. DISCUSSION AND CONCLUSIONS: The pattern of amino acid
  21.        substitutions in the V3 region is dominantly determined by particular
  22.        types of amino acid changes at the hypervariable sites. This feature can
  23.        be utilized for future development of synthesized vaccines by predicting
  24.        evolutionary direction of HIV.
  25.  DE    Amino Acid Sequence  AIDS Vaccines/ISOLATION & PURIF  Codon/GENETICS
  26.        Evolution  Human  HIV/*GENETICS/ISOLATION & PURIF  HIV Envelope Protein
  27.        gp120/*GENETICS  HIV Infections/MICROBIOLOGY  Peptide
  28.        Fragments/*GENETICS  Phylogeny  *Variation (Genetics)  MEETING ABSTRACT
  29.  
  30.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  31.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  32.  
  33.